Travaux Dirigés sur Anatomist et BrainVISA - Novembre 2009
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Travaux Dirigés sur Anatomist et BrainVISA - Novembre 2009
Table des matières
1. INTRODUCTION
TELECHARGEMENT ET INSTALLATION DES LOGICIELS
ORGANISATION DU TP
Connexion
Contenu du répertoire de formation
Programme du TP
2. Introduction à BrainVISA et Anatomist
3. Traitements des données d'IRM T1 : anatomie, segmentation, morphométrie
4. Traitement des données de diffusion
5. Traitement des données d'histologie
6. Traitement des données d'IRM fonctionnelle
7. Programmation avec BrainVISA
Liste des illustrations
3.1.
Importation d'une IRM T1
3.2.
Préparation du sujet pour le pipeline anatomique
3.3.
Pipeline anatomique 2007
3.4.
Reconnaissance automatique des sillons
3.5.
Statistiques morphométriques sur les sillons
3.6.
Gonflement du maillage de la surface corticale
4.1.
Importation des données de diffusion
4.2.
Utilisation du pipeline de Modèle de diffusion
4.3.
Utilisation du
Pipeline de Suivi de faisceaux de fibres
4.4.
Découpage de faisceaux à partir de ROIs
4.5.
Analyse de faisceaux
4.6.
Visualisation des caractéristiques des faisceaux