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Visualiser un volume
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Vous êtes parvenu à lire un volume qui apparait dans la liste
d'objets de la fenêtre de contrôle.
NB: les formats d'image actuellement supportés sont les suivants:
- VIDA [S16] (extension .vimg),
- SPM/Analyse [U8,S16,FLOAT] (extension .img)
- Tivoli/GIS [U8,S16,FLOAT] (extension .ima)
Le header du format GIS est doté de l'extension .dim,
il est en ASCII et peut donc être créé simplement
avec un éditeur, il a le format suivant:
64 64 28
-type S16
-dx 3.750000 -dy 3.750000 -dz 4.000000
Ces trois lignes correspondent aux dimensions de l'image, au type
des données (U8/S16/FLOAT ou d'autres pour la librairie Vip), et
aux dimensions des voxels.
-
DICOM (en lecture seulement)
- CAPP/ECAT
- Genesis (GE) (en lecture seulement)
- JPEG
Vous avez maintenant accès à quelques outils de visualisation
classiques:
Créez des fenêtres axiales, coronales ou sagittales en
cliquant sur les boutons adéquats:

Vous pouvez mettre le volume dans une fenêtre ou un groupe de
fenêtres de votre choix en utilisant le bouton "Add" qui agit sur
le volume et les fenêtres sélectionnés (Control-clic
permet de sélectionner plusieurs fenêtres, Shift-clic une
suite de fenêtres...). Vous pouvez également utiliser le "drag & drop" pour "prendre" des objets et les "poser" sur une fenêtre, ou sur une liste de fenêtres sélectionnées dans la fenêtre de contrôle:

NB: La seule convention actuellement utilisée dans anatomist
est la convention radiologique (la gauche est à droite et vice-versa).
Des versions ultérieures devraient permettre d'autres points de
vue...
Des zooms peuvent être effectués à volonté (Shift + bouton du milieu), ou des déplacements de l'image (Ctrl + bouton du milieu) :

Le clic (bouton gauche) de la souris permet (entre autre) d'accéder au niveau de
gris sous-jacent dans la fenêtre de commande d'où a été
lancé Anatomist:
Affichage: dionysos2.ima : (126 ,121 ,52) -> ( 60 )
NB: cette fonctionalité est bien évidemment transitoire
et ne présage en rien des moyens futurs d'accéder à
ce type d'information (volumes d'intérêts, histogrammes...)
Chaque volume dispose de sa propre table de couleurs. Il est possible
d'accéder à la table de couleurs du volume sélectionné
(en grisé dans la fenêtre de controle) à travers le
menu "Objet spécifique / couleur / palette":

Un curseur lié permet de se déplacer
simultanément dans plusieurs fenêtres
(cliquer dans une fenêtre qui est en mode curseur lié met à jour les autres fenêtres):

Il est possible de constituer plusieurs groupes de fenêtres dotés
chacun d'un curseur lié indépendant. On crée un nouveau
groupe de fenêtres en utilisant le menu "Fenêtre / lier les fenêtres" qui agit sur les fenêtres sélectionnées (grisées).
Les fenêtres qui n'appartiennent à aucun groupe explicite
sont liées entre elles
(elles appartiennent implicitement au groupe par défaut):

On pouvait modifier l'apparence du curseur lié ou le faire disparaitre grâce au menu "Réglages / Préférences", mais, hem..., cette fonctionnalité a disparu et n'a jamais été reprogrammée... mais elle reviendra un jour.