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IFR 49 : Imagerie Neurofonctionnelle, dirigé par Denis Le Bihan.
Neurospin: le nouveau centre d'imagerie en champ intense du CEA
LNAO : Laboratoire de Neuroimagerie Assistée par Ordinateur, dirigé par Jean-François Mangin, à Neurospin. Les anciens groupes d'analyse d'images et d'anatomie structurelle et MADIC, qui étaient au SHFJ sont maintenant regroupés dans ce laboratoire.
L'équipe INRIA PARIETAL, dirigé par Bertrand Thirion. Cette équipe a développé une boîte à outils IRMf pour BrainVISA.
LENA CNRS UPR640, dirigé par Line Garnero. Ce laboratoire a développé une boîte à outils EEG-MEG pour BrainVISA.
LSIS, UMR CNRS 6168, à Marseille. Ce laboratoire a développé une boîte à outils d'analyse de la surface corticale pour BrainVISA.
Le groupe d'Habib Bénali dans l'unité INSERM U678.
